El CRICC desarrolla su actividad en torno a las líneas de investigación, algunas de las cuales se encuentran integradas en grupos de investigación consolidados.

En el ámbito de la organización interna, el CRICC dispone de un Consejo de Dirección, formado por el Director y la Secretaría del Centro, juntamente con representantes de las líneas de investigación.

Cada línea concreta en planes operativos anuales el plan trienal del CRICC. Actualmente está en vigor el plan 2017-2019.